本发明公开了一种抗金黄色葡萄球菌肠毒素B的抗体及其应用,该抗体重链的可变区CDR1、CDR2、CDR3的氨基酸序列如SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6、SEQ ID NO.7所示或具有同等功能的功能性活性CDR变体组成;轻链的可变区CDR1、CDR2、CDR3氨基酸序列如SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示或具有同等功能的功能性活性CDR变体组成;该抗体能够特异结合金黄色葡萄球菌肠毒素B或者游离的肠毒素B,可以用于治疗、预防或诊断金黄色葡萄球菌感染中的用途,将可成为“非抗生素”治疗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染和控制耐药性发展研究领域的重要方向。