本发明公开了一种基于苏丹草转录组序列开发的SSR核心引物组及其应用，共23对引物，其核苷酸序列如序列表SEQUENCE ID NO.1～46所示。本发明还涉及SSR核心引物组在苏丹草遗传多态性分析中以及在苏丹草种质遗传系谱分析中的应用。本发明所述的23对SSR引物组来自苏丹草转录组序列，比以往的其他物种上的通用SSR引物相比具有多态性丰富、扩增稳定、重复性好、便于统计等优点，同时这些引物成功运用到苏丹草遗传多态性分析以及苏丹草种质遗传系谱分析，丰富了苏丹草可用SSR引物的数量，并可有效用于苏丹草种质资源遗传多态性分析、品种鉴定、指纹图谱构建、分子标记辅助育种等研究以及运用在其它禾本科高粱物种上的相关研究上。适合在生物技术领域推广应用。
