Disclosed are a system for sterilizing and preventing loss of books and a method thereof which sterilize books by automatically setting a sterilization time by being transferred with the book information through a library program linked with an organization and prevent loss of books based on identifiers attached to the books. The disclosed system for sterilizing and preventing loss of books comprises: a control device which decodes the identifiers included in the books, obtains information of the books by being linked with a book management system through a network based on the identified decode information, and automatically sterilizes the books by operating a sterilization device after automatically setting up the sterilization time based on the obtained book information and a display unit which visually displays the book information output from the control device.COPYRIGHT KIPO 2014기관 내에 연동하는 도서관 프로그램을 통해 도서 정보를 전송받아 자동으로 소독 시간을 설정하여 도서를 소독하고, 도서에 부착된 인식자(Identifiers)를 기반으로 도서 분실을 방지하도록 한 도서 소독 및 분실방지 시스템 및 그 방법이 개시된다.개시된 도서 소독 및 분실방지 시스템은, 도서에 구비된 인식자를 판독하고, 인식한 판독정보를 기초로 네트워크를 통해 도서관리 시스템과 연동하여 상기 도서의 정보를 획득하고, 획득한 도서 정보를 기반으로 소독시간을 자동으로 설정한 후 소독장치를 구동시켜 상기 도서를 자동으로 소독하는 제어장치와 상기 제어장치에서 출력되는 상기 도서의 정보를 시각적으로 표시해주는 표시부를 구비한다.