本发明涉及转植酸酶基因玉米phyA2基因特异性引物、探针及其在PCR检测中的应用,正向、反向引物序列分别为:phyA2-1F:5'-CACAGACACAGAAGTGACCTACCTC-3',phyA2-2R:5'-GGTAGTCGTAGTTGATCCATTCGTC-3'。探针序列为:phyA2-P:FAM-5'-CGACACCATCTCCACCAGCACCGT-3'-Eclipse。利用本发明设计的引物与探针序列,建立了转植酸酶基因玉米phyA2基因特异性定性PCR检测方法、SYBR Green I实时荧光定量PCR检测方法和TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法,这三种检测方法灵敏,准确,简单,可靠,具有广阔的应用价值与市场前景。