Method, system, apparatus, and computer program product for removing marker artifacts from a tomographic composite data set. In this method, the first plurality of projection images are acquired by tomography synthetic x-ray imaging, and the first plurality of projection images include at least one imaged representation of at least one alignment marker. In one aspect, an imaged representation of at least one alignment marker on a first plurality of projection images is minimized to produce a second plurality of projection images. In another aspect, a plurality of tomographic images are reconstructed from a second plurality of projected images.단층촬영합성 데이터세트로부터 마커 아티팩트를 제거하기 위한 방법, 시스템, 장치, 및 컴퓨터 프로그램 제품. 이 방법에서, 제1 복수의 투영 이미지는 단층촬영합성 x-선 이미징에 의해 획득되고, 제1 복수의 투영 이미지는 적어도 하나의 정렬 마커의 적어도 하나의 이미징된 표현을 포함한다. 일 측면에서, 제1 복수의 투영 이미지 상의 적어도 하나의 정렬 마커의 이미징된 표현은 제2 복수의 투영 이미지를 생성하도록 최소화된다. 다른 일 측면에서는, 복수의 단층촬영 이미지가 제2 복수의 투영 이미지로부터 재구성된다.