An automated bioreactor system (100) for decellularizing an organ (5) such as the lung comprises a main chamber (15) for containing the organ and at least one reagent chamber (11 for containing a liquid phase reagent). ). The reagent conduit delivers the liquid phase reagent to the main chamber and the perfusion conduit delivers the reagent from the reagent outlet (23) of the main chamber to the organ. The perfusion pump (21) flows the reagent. The perfusion pressure sensor (25) detects the pressure of the flowing reagent. The control system (50) controls the perfusion pump to flow reagents based on the received input representing the desired pressure and the received input of the detected pressure. The control system automatically performs all steps of the decellularization protocol based on the sensor input. An automated waste decontamination system (30) can also be provided.肺のような臓器（５）を脱細胞化するための自動バイオリアクタシステム（１００）は、臓器を収容するための主チャンバ（１５）と、液相試薬を収容する少なくとも１つの試薬チャンバ（１１）を備える。試薬導管は、液相試薬を主チャンバに送達し、灌流導管は、試薬を主チャンバの試薬出口（２３）から臓器へ送達する。灌流ポンプ（２１）は、試薬を流す。灌流圧センサ（２５）は、流動する試薬の圧力を検出する。制御システム（５０）は、灌流ポンプを制御して、所望の圧力を表す受け取った入力と検出した圧力の受け取った入力に基づいて試薬を流す。制御システムは、センサの入力に基づいて自動的に脱細胞化プロトコルのすべての工程を行う。自動廃棄物の除染システム（３０）も提供できる。
