本发明涉及一种能够在哺乳动物肌肉组织中特异启动基因表达的启动子序列,所述序列包含SEQ ID NO.1的核苷酸序列或者与其互补的核苷酸序列。所述肌肉组织特异启动子序列还包括酶切位点,所述的酶切位点位于SEQ ID NO.1的核苷酸序列或者与其互补的核苷酸序列的两端,所述的酶切位点分别是xhol和hind III。所述序列涉及含有上述肌肉特异启动子序列的表达载体。所述序列涉及上述载体在制备转基因哺乳动物或转染哺乳动物细胞中的应用。该发明技术涉及肌肉组织特异性启动子,通过构建相应的表达载体,基因的表达只限于肌肉组织,在基因工程中起到较好的作用。通过外源基因在动物骨骼肌中的特异性表达可很好的研究肌肉的分化或基因的功能及改善肌肉的风味与质量。