A method of acquiring a functional image whose artifacts due to a motion of an object are corrected includes acquiring functional image data of an object, acquiring structural image data of the object, acquiring motion information of the object based on the structural image data, correcting the functional image data based on the motion information related to motion of the object, and obtaining a functional image of the object.구조적 영상 데이터를 이용하여 기능적 영상 데이터를 보정함으로써 대상체의 움직임에 의해 발생한 아티팩트가 보정된 기능적 영상을 획득하는 방법을 제공한다.기능적 영상 획득방법은 대상체에 대한 기능적 영상 데이터를 획득하고, 대상체에 대한 구조적 영상 데이터를 획득하고, 구조적 영상 데이터에 기초하여 대상체의 움직임과 관련된 정보를 획득하고, 대상체의 움직임과 관련된 정보를 기초로, 기능적 영상 데이터를 보정하여 대상체에 대한 기능적 영상을 획득한다.