The present invention relates to a pharmaceutical composition for preventing or treating a brain injury disease comprising T-cell immunoglobulin and mucin domain protein 3 (TIM-3) inhibitor as an active ingredient, and a screening method for treating a brain injury disease using TIM-3 will be. The present inventors have found that TIM-3 protein acts as a regulator in hypoxia-induced brain damage induced by ischemia, and TIM-3 expression is regulated by HIF-1, which regulates gene expression occurring in a hypoxic state . Therefore, the present invention can be usefully used for the treatment and prevention of neurological diseases accompanied by hypoxia.본 발명은 TIM-3 (T-cell immunoglobulin and mucin domain protein 3) 억제제를 유효성분으로 포함하는 뇌손상 질환의 예방 또는 치료용 약학적 조성물 및 TIM-3를 이용한 뇌손상 질환 치료제의 스크리닝 방법에 관한 것이다. 본 발명자들은 허혈에 의해 발생하는 저산소(hypoxia) 상태시 유발되는 뇌손상에서 TIM-3 단백질이 조절자로서 역할하며, TIM-3의 발현이 저산소 상태에서 발생하는 유전자 발현을 조절하는 HIF-1에 의해 조절받는다는 것을 밝혔다. 따라서, 본 발명은 저산소증이 수반되는 뇌신경계 질환의 치료 및 예방을 위해 유용하게 사용될 수 있다.