The present invention is to purify and oxidize and purify only manure in a state in which contaminants are excluded, thereby preventing clogging of hydroxyl radical generators by contaminants present with livestock manure, and cleaning the house with radical water made by treating manure. A livestock manure treatment system using hydroxyl radicals that can be used to improve the health of livestock.The supernatant is transferred from the auxiliary oxidation tank to the main oxidation tank while the contaminants are minimized, and the supernatant is hydrated with a bubble ejector located inside the main oxidation tank ( OH) Since it is oxidized and purified with radicals, it has the effect of blocking the occurrence of clogging of the bubble ejector by contaminants.본 발명은 협잡물이 제외된 상태의 분뇨만을 정제하여 산화 및 정화 처리함으로써, 가축의 분뇨와 함께 존재하는 협잡물에 의한 수산화 라디칼 발생기의 막힘을 방지하고, 분뇨를 처리하여 만들어진 라디칼수로 축사의 청결과 가축의 건강 증진에 활용할 수 있는 수산화 라디칼을 이용한 축산분뇨 처리 시스템에 관한 것으로, 보조산화조에서 협잡물이 최소화된 상태에서 상등액을 메인산화조로 이송하고, 메인산화조 내부에 위치한 버블이젝터로 상등액을 수산화(OH) 라디칼로 산화 및 정화시켜주기 때문에, 협잡물에 의한 버블이젝터의 막힘 발생을 원천 차단해주는 효과가 있다.