本发明公开了一种经修饰改造的犬α1-干扰素基因及犬α1-干扰素的制备方法。修饰改造后的犬α1-干扰素基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其编码氨基酸的序列如SEQ ID NO.2所示。本发明具体涉及犬α1-干扰素密码子对酵母密码子偏嗜性的匹配、改造,高效生产犬α1-干扰素的培养方法、避免污染的措施、确定加甲醇的量以及时间、对蛋白表达时间的控制即蛋白收获时间、无菌检验、蛋白含量以及活性测定、扩大培养条件等操作方法的优化控制,本发明方法简单易行,成本较低,实现了犬α1-干扰素在毕赤酵母中稳定高效的表达,表达的犬α1-干扰素对犬病毒性传染病有显著的疗效,可以增强狂犬疫苗的免疫效果。