In the present invention, as a result of detailed research into the expression, over-amplification, mutation and translocation, and the like of FGFR coding genes in a variety of cancer cells, a novel fusion polypeptide obtained by fusion of FGFR3 polypeptide with another polypeptide was identified and isolated in multiple urinary bladder cancer-derived cells and lung cancer cells. By using this fusion polypeptide as a biomarker in cancer therapy with an FGFR inhibitor, it is possible to preemptively prevent the manifestation of side effects in therapy with an FGFR inhibitor and control the therapeutic mode such that the best possible therapeutic results are obtained, and individualized medical treatment is possible.Se estudió extensamente al gen que codifica para FGFR con respecto a su expresión, hiperamplificación, mutación, translocación o similares en diversas células cancerosas, como un resultado, se identificaron y aislaron polipéptidos de fusión novedosos en los cuales el polipéptido FGFR3 está fusionado con un polipéptido diferente, a partir de diversos tipos de células derivadas de cáncer de vejiga y células de cáncer de pulmón. El uso de un polipéptido de fusión de la presente invención como un biomarcador en un tratamiento contra el cáncer basado en inhibidor de FGFR permite evitar los efectos secundarios en el tratamiento contra el cáncer y controlar la condición terapéutica para producir el mejor efecto terapéutico y de esta manera se habilita medicina individualizada.