The present invention provides an antimicrobial peptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 10, a method for discovering the same, and an antimicrobial pharmaceutical composition comprising the same, a food preservative, a feed additive, and a cosmetic additive. The PR-35 antimicrobial peptide derived from the natural variant of the pig gene of the present invention and a pharmaceutical composition comprising the same have lower cytotoxicity than the conventional PR-39 peptide and have excellent antibacterial activity against Gram-negative bacteria for multi-drug resistance in the medical and pharmaceutical fields. It can be useful as an alternative antibiotic.본 발명은 서열번호 10의 아미노산 서열로 이루어진 항균 펩타이드, 이의 발굴 방법 및 이를 포함하는 항균용 약학 조성물, 식품방부제, 사료첨가제 및 화장품 첨가제를 제공한다.본 발명의 돼지 유전자 자연 변이체 유래의 PR-35 항균 펩타이드 및 이를 포함하는 약학 조성물은 종래의 PR-39 펩타이드보다 세포독성이 낮으면서 그람 음성균에 대한 항균 활성이 우수하여 의학 및 약학 분야에서 다제내성용 대체 항생제로서 유용하게 사용될 수 있다.