本发明涉及一种BANCR基因敲减稳转细胞、其构建方法和应用。本发明所述方法包括:制备携带有BANCR基因干扰序列的重组慢病毒,其中,所述干扰序列如SEQ ID NO:3所示;以及,将所述重组慢病毒转染细胞,进行筛选和鉴定,得到BANCR基因敲减稳转细胞。本发明采用特定干扰序列,通过重组慢病毒的方式能够将人BANCR基因的表达敲减至20~30%左右,可解决高效敲减BANCR基因的技术问题;本发明获得BANCR基因稳定敲减的细胞能够用于制备动物模型、研发药物以及基因治疗,为BANCR基因的功能研究提供平台,也为后续的基因治疗方法提供理论依据和支持。