本发明属于植物基因工程领域,具体公开了一种提高棉花耐旱和耐盐碱能力的sgRNA,该sgRNA的靶标序列由SEQ ID No.1所示的核苷酸序列组成。本发明还公开了该sgRNA在提高棉花耐旱和耐盐碱能力的用途。本发明sgRNA依据陆地棉和海岛棉所有GI同源基因的保守区域设计的,可单独或者同时编辑不同的GI基因,其基因编辑效率高;其次,与野生型植株相比,利用本发明sgRNA对单个Gigantea(GI)基因进行编辑所得的棉花突变体植株的耐旱、耐盐碱能力均获得显著提高;此外,利用本发明sgRNA沉默GI基因的表达对于提高棉花产量和提高棉花纤维品质具有重要意义。