本发明公开了一种翘嘴鳜IFN‑α3基因、重组蛋白、制备方法及应用。本发明通过采用cDNA末端快速扩增RACE技术克隆翘嘴鳜IFN‑α3全长cDNA序列，如SEQ ID NO：1所示；利用带有酶切位点的引物克隆出该cDNA序列的ORF序列；将ORF序列克隆入pMD19T载体后，再用EcoR I和Xho I进行双酶切得到目的片段；用EcoR I和Xho I对pET32a(+)载体进行双酶切，将该双酶切载体与所述目的片段连接，得到pET32a(+)‑IFN‑α3重组表达载体，转入DH5α感受态细胞，挑选阳性克隆并提取保存质粒；将质粒转入表达菌BL21，经IPTG诱导表达获得IFN‑α3重组蛋白，如SEQ ID NO：2所示。该IFN‑α3重组蛋白可用于浸泡免疫预防翘嘴鳜病毒病方面，能够有效激活翘嘴翘嘴鳜进入抗病毒状态，降低死亡率。
