The present disclosure relates to a method and system for registering multi-modality images. The method may include: acquiring a first image relating to a registration model, wherein the registration model includes a plurality of reference objects acquiring a second image relating to the registration model determining a set of reference points based on the plurality of reference objects determining a set of mapping data corresponding to the set of reference points in the first image and the second image and determining one or more registration parameters based on the set of mapping data.La présente invention concerne un procédé et un système denregistrement dimages à modalités multiples. Le procédé peut consister : à acquérir une première image concernant un modèle denregistrement, le modèle denregistrement comprenant une pluralité dobjets de référence à acquérir une seconde image concernant le modèle denregistrement à déterminer un ensemble de points de référence sur la base de la pluralité dobjets de référence à déterminer un ensemble de données de mappage correspondant à lensemble de points de référence dans la première image et la seconde image et à déterminer un ou plusieurs paramètres denregistrement sur la base de lensemble de données de mappage.