本发明公开了猪传染性胃肠炎病毒抗原融合基因及重组巨大芽孢杆菌菌株和应用。本发明提供了一种由猪传染性胃肠炎病毒Sad序列与化脓链球菌细胞壁锚定序列连接在一起后得到的抗原融合基因,其核苷酸序列为SEQ ID No.1所示。本发明进一步提供了含有该抗原融合基因的重组表达载体以及含有该重组表达载体的重组巨大芽孢杆菌菌株。将本发明的重组巨大芽孢杆菌菌株用木糖进行诱导,抗原融合基因可以在该细菌细胞壁的表面进行表达。免疫印迹实验表明,所表达的重组蛋白能够与TGEV免疫血清发生反应,表明本发明重组蛋白与TGEV天然抗原一样具有相同的抗原性,可将其制备成防治猪传染性胃肠炎的安全、有效的粘膜免疫活菌疫苗。