A method of manufacturing a medical antimicrobial suture having a grapefruit extract which is a grapefruit seed extract including naringin, ascorbic acid or citral is provided. The method includes preparing grapefruit extract solution with a concentration of 500 to 2000 ppm by mixing the grapefruit extract with methanol solvent and impregnating a biodegradable monofilament suture with the grapefruit extract solution for more than 360 minutes. The grapefruit extract is continuously released in a body for 70 hours after the antimicrobial suture is inserted into the body.본 발명은 봉합사에 자몽추출물이 함유된 것을 특징으로 하는 의료용 항균 봉합사 및 그 제조방법에 관한 것이다. 본 발명의 의료용 항균 봉합사는 봉합사에 항균 효과가 있는 자몽추출물을 함유시킴으로써, 봉합사에 항균 기능을 부여하여 봉합사에 의해 발생하는 병원균 감염을 방지할 수 있다.