本发明属于植物基因工程领域,公开了一种促进植物种子超长链脂肪酸积累的基因的应用,其中,基因片段具有如SEQ ID No.1~SEQ ID No.5任意一条所示的核苷酸序列或其互补序列,或者是与这些核苷酸序列同源性不小于95%、且功能相同的衍生核苷酸序列;超长链脂肪酸的碳链碳数大于18,基因片段能够提升植物种子磷脂酰胆碱(PC)和/或磷脂酰乙醇胺(PE)中超长链脂肪酸的占比。本发明通过使用十字花科植物来源的LPAT2基因(核苷酸序列例如如同SEQ ID No.1~SEQ ID No.5所示),能够提高植物种子超长链脂肪酸在磷脂酰胆碱和磷脂酰乙醇胺中的百分含量,克服了当前领域内遇到的技术瓶颈。