An exemplary embodiment of the present invention provides a three-dimensional virtual liver surgery planning system including: a digital imaging and communications in medicine (DICOM) receiving module which receives an abdomen computer tomography (CT) volume data set from a picture archiving and communication system (PACS) server a DICOM loading and noise removing module which loads the received abdomen CT volume data set and remove noises a standard liver volume estimation module which estimates a standard liver volume (SLV) from the denoised abdomen CT volume data set a liver extraction module which extracts a three-dimensional liver region a vessel extraction module which extracts a three-dimensional vessel region including a portal vein, a hepatic artery, a hepatic vein, and an inferior vena cava (IVC) a tumor extraction module which extracts a three-dimensional tumor region a liver segmentation module which divides the extracted three-dimensional liver region into several segments using landmarks which are selected by a user or a segmentation sphere and a liver surgery planning module which makes a three-dimensional liver surgery plan using a resection surface, a liver segments, or the segmentation sphere.본 발명의 일 실시예에 따른 3차원 가상 간 수술 계획 시스템은, PACS 서버로부터 복부 CT 볼륨 데이터 세트를 수신 받는 DICOM 수신 모듈과, 상기 수신된 복부 CT 볼륨 데이터 세트를 로딩하고 노이즈를 제거하는 DICOM 로딩 및 노이즈 제거 모듈과, 상기 노이즈가 제거된 복수 CT 볼륨 데이터 세트로부터 표준 간용적(SLV)을 추정하는 표준 간용적 추정 모듈과, 3차원 간 영역을 추출하는 간 추출 모듈과, 간문맥, 간동맥, 간정맥, 그리고 하대정맥(IVC)을 포함하는 3차원 혈관 영역을 추출하는 혈관 추출 모듈과, 3차원 종양 영역을 추출하는 종양 추출 모듈과, 상기 추출된 3차원 간 영역을 사용자가 선정한 참조점 또는 구형 편집 도구에 의해 복수 개의 구획으로 구분하는 간 구획화 모듈과, 절단 평면, 간 구획, 또는 구형 편집 도구를 활용해 3차원 간 수술 계획을 수행하는 간 수술계획 모듈을 포함한다.