A fluid filtration apparatus is provided which includes at least a functional biomedical device having an inlet and an outlet, a first biological fluid container in fluid communication with the inlet of said functional biomedical device, a first biological fluid receiving container downstream of the functional biomedical device in fluid communication with the outlet of the functional biomedical device, and having an excess of fluid, such as air or gas, in the first biological fluid container or biological fluid receiving container (either placed therein during manufacture, or added later) sufficient to drain the system. A method of using the apparatus is disclosed.Appareil de filtration de fluide comprenant au moins un dispositif biomédical fonctionnel doté dune entrée et dune sortie, un premier récipient pour fluide biologique en communication fluidique avec lentrée dudit dispositif biomédical fonctionnel, un premier récipient récepteur de fluide biologique en aval du dispositif biomédical fonctionnel et en communication fluidique avec la sortie du dispositif biomédical fonctionnel, et présentant un excès de fluide, tel que de lair ou du gaz, dans le premier récipient pour fluide biologique ou dans le premier récipient récepteur de fluide biologique (soit placé dedans en cours de fabrication, soit ajouté ultérieurement) suffisant pour vidanger le système. Linvention concerne également un procédé dutilisation de lappareil.