The present invention relates to a protein engineering technique for improving the efficacy of a target protein. More particularly, there is provided a method for selecting a permissive site capable of genetic modification, chemical modification, or heterologous protein fusion in a target protein library having a fusion protein wherein the folding reporter protein is inserted at various internal positions of the target protein, A method for producing a modified target protein by performing a mutation, chemical modification or heterologous protein fusion at a site, a target protein prepared by the method, and a novel modified target protein.본 발명은 표적 단백질의 효능 개선을 위한 단백질 공학 기술에 관한 것이다. 보다 구체적으로 폴딩 리포터 단백질이 표적 단백질의 다양한 내부 위치에 삽입된 융합 단백질을 갖는 표적 단백질 라이브러리에서 유전적 변형, 화학적 수식, 또는 이종 단백질 융합이 가능한 허용 위치를 선별하는 방법, 상기 방법으로 선별된 허용 위치에 돌연변이, 화학적 수식 또는 이종 단백질 융합을 수행하여 변형된 표적 단백질을 제조하는 방법, 상기 방법에 의해 제조된 표적 단백질 및 신규한 변형된 표적 단백질에 관한 것이다.