本发明提供了一种用于柑橘枝瘤病原菌检测的引物对,其中正义引物SPT1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示:5′-GAACGCAGCGAAATGCGATAAG- 3′,反义引物SPT2的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示:5′-ATGCTNAAGTTCAGCGGGTAT- 3′。本发明同时还提供了使用上述引物对检测柑橘枝瘤病原菌的方法,包括以下步骤:(1)、提取目标物DNA;(2)、使用权利要求1所述引物对针对目标物DNA进行PCR扩增,得到PCR反应产物;(3)、使用凝胶电泳法对PCR反应产物进行检测。本发明提供的技术方案能准确、快速诊断出柑橘是否携带柑橘枝瘤病原菌;同时,该方法重复性好,灵敏度高,目标物DNA只需要100ng/μL就可以鉴定出柑橘携带病原真菌的种类。