本发明公开了一种转植酸酶基因玉米外源基因插入位点旁侧序列及检测方法,所述旁侧序列为3’端旁侧序列,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。所述检测方法包括以下步骤:提取玉米基因组DNA模板;依据SEQ ID No.1中1~3655bp位序列设计正向引物,依据SEQ ID No.1中3656~5299bp位序列设计反向引物;配制PCR反应体系;进行PCR扩增反应;将扩增产物在琼脂糖胶上电泳,若能够扩增出206bp产物,则样品为转植酸酶基因玉米BVLA430101。本发明能够高效、灵敏、准确地鉴定植酸酶基因玉米BVLA430101,以及以转植酸酶基因玉米BVLA430101为亲本的玉米品系。