A step S6 for calculating the first translational compensation amount and the rotation correction amount based on the position and orientation of the first portion of the subject indicated by the transmission image of the subject, the radiation therapy apparatus control method according to the present invention, the the step S9 to calculate the second translational compensation amount based on its rotational compensation amount and position and orientation of the second region of the subject represented by the transmitted images, couch to rotate moved by the rotation correction amount, and couch as translated by the second translation-correction amount, and a step S10 for driving the couch. The first site, the second site is larger than. Compared to adjusting the position of the couch by using only the position and orientation of one of the second portion or the first portion, the radiotherapy apparatus control method, a predetermined higher accuracy second portion It can be placed in position.本発明による放射線治療装置制御方法は、被検体の透過画像により示される被検体の第1部位の位置と向きとに基づいて回転補正量と第1並進補正量とを算出するステップS6と、その透過画像により示される被検体の第2部位の位置と向きとその回転補正量とに基づいて第2並進補正量とを算出するステップS9と、カウチがその回転補正量だけ回転移動するように、かつ、カウチがその第2並進補正量だけ平行移動するように、カウチを駆動するステップS10とを備えている。第1部位は、第2部位より大きい。このような放射線治療装置制御方法は、第1部位または第2部位の一方の位置と向きとだけを用いてカウチの位置を調整することに比較して、第2部位をより高精度に所定の位置に配置させることができる。