The invention provides an endoglycosidase designated EndoS49 and having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. EndoS49 isolated from Streptococcus pyogenesone strain NZ131 is an EndoS homolog. EndoS49 has specific endoglycosidase activity against native IgG and cleaves a wider range of Fc glycans than EndoS. A mutant was obtained with the replacement of glutamic acid at position 186 of SEQ ID NO: 1: this mutant does not have endoglycosidase activity, but is able to bind to IgG. Methods using EndoS49, its deletions and said mutant are disclosed, especially for evaluating IgG glycosylation or IgG isolation.Согласно изобретению предложена эндогликозидаза, обозначаемая EndoS49 и имеющая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1. EndoS49 выделяли из штамма NZ131 Streptococcus pyogenes, она представляет собой гомолог EndoS. EndoS49 обладает специфичной эндогликозидазной активностью в отношении нативного IgG и расщепляет более широкий спектр гликанов Fc, чем EndoS. Получен ее мутант с заменой глутаминовой кислоты в положении 186 SEQ ID NO: 1: указанный мутант не обладает эндогликозидазной активностью, но способен связываться с IgG. Раскрыты способы с применением EndoS49, ее делеций и указанного мутанта, особенно для оценки гликозилирования IgG или выделения IgG.