A method for isolating one or more compounds from a microbial mass containing microorganisms that have produced said one or more compounds comprising the procedure: (a) preparing or obtaining wet cells having an average moisture content between 30% and 80%; (b) subject the wet cells to primary drying using a conduction heating system of the thermal adhesion conveyor type to obtain primary dry cells in the form of scales and having an average moisture content between 5% and 50%; (c) subject the primary dry cells that have been obtained in (b) to secondary drying using a convection heating system to obtain secondary dry cells having an average moisture content of not more than 10%; and (d) extract, isolate, purify and / or refine the compound or each of the dry cell compounds.Un procedimiento para aislar uno o más compuestos de una masa microbiana que contiene microorganismos que han producido dichos uno o más compuestos comprendiendo el procedimiento: (a) preparar u obtener células húmedas que tienen un contenido en humedad promedio entre 30% y 80%; (b) someter a las células húmedas a secado primario usando un sistema de calentamiento por conducción del tipo de transportador de adhesión térmica para obtener células secas primarias en forma de escamas y que tienen un contenido en humedad promedio entre 5% y 50%; (c) someter a las células secas primarias que se han obtenido en (b) a secado secundario usando un sistema de calentamiento por convección para obtener células secas secundarias que tienen un contenido en humedad promedio no mayor de 10%; y (d) extraer, aislar, purificar y/o refinar el compuesto o cada uno de los compuestos de las células secas.