Disclosed is a multichannel autosampling urolithiasis etiological diagnosis system, comprising a biochemical analyzer (100), an electronic medical record system (200), a multichannel liquid chromatography device (300), and a digital photomicrography device (400), also comprising a central processing computer (500). The biochemical analyzer (100), the electronic medical record system (200), the multichannel liquid chromatography device (300), and the digital photomicrography device (400) respectively are connected to the central processing computer (500). Also disclosed is an application method for the urolithiasis etiological diagnosis system. The present diagnosis system standardizes and automates the complex workflow of etiological diagnosis.Linvention concerne un système de diagnostic étiologique durolithiase à auto-échantillonnage multicanaux, comprenant un analyseur biochimique (100), un système de dossier médical électronique (200), un dispositif de chromatographie en phase liquide multicanaux (300) et un dispositif de photomicrographie numérique (400), et comprenant également un ordinateur central de traitement (500). Lanalyseur biochimique (100), le système de dossier médical électronique (200), le dispositif de chromatographie en phase liquide multicanaux (300) et le dispositif de photomicrographie numérique (400) sont respectivement reliés à lordinateur central de traitement (500). Linvention concerne également un procédé dapplication du système de diagnostic étiologique durolithiase. Le présent système de diagnostic normalise et automatise le flux de travail complexe dun diagnostic étiologique.