本发明公开了c‑kit突变相关抗原短肽及其应用。所述c‑kit突变相关抗原短肽的序列如SEQ ID NO:1‑20任一所示。该短肽具有与DC细胞上MHC I分子高度的亲和力,并能有效地刺激、诱导产生特异性细胞毒性T淋巴细胞(CTLs),可用于c‑kit基因突变细胞的免疫清除,进而预防c‑kit基因突变相关疾病的发生,尤其是c‑kit基因突变相关肿瘤疾病的预防;因此本发明的c‑kit抗原短肽具备良好的多肽疫苗及DC疫苗的潜力,具有良好的临床转化及疾病预防潜力。而且,本发明的c‑kit抗原短肽长度较短,化学合成难度小,可以直接合成得到高纯的产物,应用成本大大降低,同时效果明确,具有很好的应用前景。