Method for microbiological cleaning an interior space, which method comprises a first step, which is the automatic atomizing a biocide decontaminating, and a subsequent second step, which is the atomization of a biological culture benign forming aerobic spores benign consisting of Bacillus species for biological stabilization and displacement of bodies that may have survived the decontamination step, and where atomization both provides steps microdroplets of 5 to 10 microns, resulting in cleaning not only surface but also of the air itself inside the space.Método para la limpieza microbiológica de un espacio interior, método el cual comprende un primer paso, que es la atomización automática de un biocida que descontamina, y un segundo paso siguiente, que es la atomización de un cultivo biológico benigno de formadores de esporas aerobias benignas consistente en especies de Bacillus para la estabilización biológica y el desplazamiento de organismos que puedan haber sobrevivido al paso de descontaminación, y donde la atomización en ambos pasos proporciona microgotas de 5 a 10 micras, lo que resulta en una limpieza no sólo de superficies sino también del propio aire en el interior del espacio.