PLATEFORME D'ANALYSE SPATIALE DE PATHOLOGIE À SYSTÈMES DE CALCUL POUR DONNÉES D'IMAGERIE CELLULAIRES ET INFRACELLULAIRES À PARAMÈTRES MULTIPLES IN SITU OU IN VITRO
UNIVERSITY OF PITTSBURGH-OF THE COMMONWEALTH SYSTEM OF HIGHER EDUCATION
发明人:
CHENNUBHOTLA, Srinivas C.,PULLARA, Filippo,TAYLOR, Douglass L.
申请号：
USUS2019/066446
公开号：
WO2020/131658A1
申请日:
2019.12.16
申请国别(地区):
US
年份:
2020
代理人:
摘要：
A computational systems pathology spatial analysis platform includes: (i) a spatial heterogeneity quantification component configured for generating a global quantification of spatial heterogeneity among cells of varying phenotypes in multi-parameter cellular and subcellular imaging data； (ii) a microdomain identification component configured for identifying a plurality of microdomains for tissue samples based on the global quantification, each microdomain being associated with a a tissue sample； and (iii) a weighted graph component configured for constructing a weighted graph for the multi-parameter cellular and subcellular imaging data, the weighted graph having a plurality of nodes and a plurality of edges each being located between a pair of the nodes, wherein in the weighted graph each node is a particular one of the microdomains and the edge between each pair of microdomains in the weighted graph is indicative of a degree of similarity between the pair of the microdomains.La présente invention concerne une plateforme d'analyse spatiale de pathologie à systèmes de calcul comprenant : (i) un composant de quantification d'hétérogénéité spatiale configuré pour générer une quantification globale d'hétérogénéité spatiale parmi les cellules de phénotypes variés dans des données d'imagerie cellulaires et infracellulaires à paramètres multiples ； (ii) un composant d'identification de microdomaine configuré pour identifier une pluralité de microdomaines pour des échantillons de tissu sur la base de la quantification globale, chaque microdomaine étant associé à un échantillon de tissu ； et (iii) un composant de graphe pondéré configuré pour construire un graphe pondéré pour les données d'imagerie cellulaires et infracellulaires à paramètres multiples, le graphe pondéré ayant une pluralité de nœuds et une pluralité de bords étant chacun situé entre une paire des nœuds, dans le graphe pondéré chaque nœud étant l'un particulier des microdomaines et le bord entre chaque pair
