The present invention relates to a method for purifying polysaccharide protein conjugates using mixed mode chromatography. The method comprises contacting a crude polysaccharide protein conjugate with a mixed mode resin comprising an inert porous shell and an active core under conditions of low conductivity to allow the binding of contaminants to a ratio of flowthrough To obtain a conjugated polysaccharide protein conjugate.본 발명은 혼합 모드 크로마토그래피를 이용하여 다당류 단백질 접합체를 정제하는 방법에 관한 것이다. 상기 방법은 오염 물질의 결합을 허용하는 저전도성 조건하에서 불활성 다공성 쉘(shell) 및 활성 코어(core)를 포함하는 혼합 모드 레진과 조(crude) 다당류 단백질 접합체를 접촉시키고 통과액(flowthrough)의 비결합 다당류 단백질 접합체를 수득한다.