The invention relates to an installation adapted to the implementation of a process for purifying a first polyunsaturated fatty acid from an initial mixture, the initial mixture comprising at least one second fatty acid in addition to the first polyunsaturated fatty acid. the method comprising:at least one stage of chromatographic separation in the liquid phase of the first polyunsaturated fatty acid and the second fatty acid, making it possible to recover, on the one hand, a stream enriched with the first polyunsaturated fatty acid and, on the other hand, a stream enriched with the second fatty acid;a stage of treatment of the stream enriched with the first polyunsaturated fatty acid, leading to a reduction of the peroxide number and / or the anisidine number of this stream.L'invention concerne une installation adaptée à la mise en oeuvre d'un procédé de purification d'un premier acide gras polyinsaturé à partir d'un mélange initial, le mélange initial comprenant au moins un deuxième acide gras en plus du premier acide gras polyinsaturé, le procédé comprenant :- au moins une étape de séparation chromatographique en phase liquide du premier acide gras polyinsaturé et du deuxième acide gras, permettant de récupérer d'une part un flux enrichi en premier acide gras polyinsaturé et d'autre part un flux enrichi en deuxième acide gras ;- une étape de traitement du flux enrichi en premier acide gras polyinsaturé, conduisant à une diminution de l'indice de peroxyde et / ou de l'indice d'anisidine de ce flux.