PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an endoscope apparatus accurately and surely acquiring a reference image of a scope at a place other than a plant or the like, and to provide a setting method of the reference image of the endoscope apparatus.SOLUTION: This endoscope apparatus 1 includes a body section 4 to which the scope having an image pickup device at a distal end portion of an insertion portion 7 is detachably attachable, a video signal processing section 22, a display section 5 and a control section 21. The control section 21 displays on the display section 5 an initialization instruction screen for instructing a user to start an initialization processing to acquire a reference image of the image pickup device, displays on the display section 5 a message for instructing the user to light-shield the distal end portion according to an instruction to start initialization processing, acquires the reference image with the distal end portion light-shielded and stores the acquired reference image in a memory 27.COPYRIGHT: (C)2012,JPO&INPIT【課題】スコープのリファレンス画像の取得を、工場等でない場所において、正確にかつ確実に行うことができる内視鏡装置及び内視鏡装置のリファレンス画像の設定方法を提供する。【解決手段】内視鏡装置1は、挿入部7の先端部に撮像素子を有するスコープが着脱可能な本体部4、映像信号処理部22、表示部5及び制御部21を有する。制御部21は、撮像素子のリファレンス画像の取得のための初期設定処理の開始をユーザに指示させるための初期設定指示画面を表示部5に表示し、初期設定処理の開始の指示に応じて、先端部の遮光をユーザにさせるためメッセージを表示部5に表示し、先端部の遮光がされた状態で、リファレンス画像を取得し、取得されたリファレンス画像を、メモリ27に格納する。【選択図】図2