An object of the present invention is a pet protection system that enables pets to rest comfortably and safely in public places or commercial facilities, so that owners of pets can safely use public places or commercial facilities, and It is to provide a method of use. In order to achieve the above object, the pet protection system according to the present invention includes a plurality of mobile communication terminals in which an app is installed through a QR code to protect pets; And a pet protection house that receives a unique QR code through the app and opens a door locked by the unique QR code.본 발명의 목적은 공공 장소 또는 상업 시설에서 애완 동물이 편히 쉴 수 있음과 아울러 안전하게 보호받을 수 있어 애완 동물을 반려하는 주인이 안심하고 공공 장소 또는 상업 시설을 이용할 수 있도록 하는 애완 동물 보호 시스템 및 그 이용 방법을 제공하는 것이다.상기 목적을 달성하기 위해, 본 발명에 따른 애완 동물 보호 시스템은, 애완 동물을 보호하기 위해 QR 코드를 통해 앱이 설치되는 복수의 이동 통신 단말; 및 상기 앱을 통해 고유 QR 코드를 제공받고, 상기 고유 QR 코드에 의해 잠금된 도어가 개방되는 애완 동물 보호 하우스를 포함하는 것을 특징으로 한다.