本发明公开了来自盐芥的一个耐盐基因及其编码蛋白与应用。其目的是提供来自盐芥的一个耐盐基因及其编码蛋白与其在培育耐盐性提高植物中的应用。该基因可具有下述核苷酸序列之一:1)序列表中SEQ ID №:1的DNA序列;2)编码序列表中SEQ ID №:2的DNA序列;3)在高严谨条件下可与序列表中SEQ ID №:1限定的DNA序列杂交的核苷酸序列。编码具有下述氨基酸残基序列之一的蛋白质:1)序列表中的SEQ ID №:2;2)将序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一至十个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有提高植物耐盐性作用的蛋白质。本发明的耐盐基因将在培育耐盐性增强的植物(特别是水稻、小麦等农作物)中发挥重要作用。