The present invention relates to a method and a system for selecting an anticancer drug based on individual protein damage information by using an individual genome sequencing analysis. According to the present invention, the method and the system are a highly reliable and widely applicable technology which can predict a side effect or a risk on a specific drug, in other words, an anticancer drug, for each individual by performing a sequence analysis of an exon part of a gene for coding various proteins involved in pharmacokinetics or pharmacodynamics of the anticancer drug.COPYRIGHT KIPO 2016본 발명은 개인 유전체 염기서열 분석을 이용한, 개인별 단백질 손상 정보 기반의 항암제 선택 방법 및 시스템에 관한 것으로, 본 발명에 따른 방법 및 시스템은 항암제의 약력학 또는 약동학에 관여하는 다양한 단백질을 코딩하는 유전자 엑손 영역의 서열 분석을 통하여 개인별로 특정 약물, 즉 항암제에 대한 부작용 또는 위험성을 예측할 수 있는 기술로서 신뢰도가 높을 뿐 아니라, 적용범위 또한 넓은 범용적 기술이다.