本发明公开了一种细粒棘球蚴及加拿大棘球蚴EG95/EC95蛋白组合的制备及应用;所述重组蛋白组合包括dEG95和dEC95氨基酸序列;dEG95氨基酸序列为狭义细粒棘球绦虫的EG95删去N端的信号肽区域及C端的跨膜区,得到的修饰后的氨基酸序列;EG95基因序列如SEQ ID NO.1所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;dEC95氨基酸序列为加拿大棘球绦虫的EC95删去N端的信号肽区域及C端的跨膜区,得到的修饰后的氨基酸序列;EC95基因序列如SEQ ID NO.4所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.5所示。本发明的方法具备蛋白表达量高、工艺简单、生产成本低等优点。