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DOSAGE SRM/MRM DE LA PROTÉINE SUBSTRAT DU RÉCEPTEUR À L'INSULINE 1 (IRS1)
专利权人:
Expression Pathology; Inc.
发明人:
申请号:
EP10843591.8
公开号:
EP2517002A1
申请日:
2010.12.22
申请国别(地区):
EP
年份:
2012
代理人:
摘要:
The present invention is related to a method for selecting a treatment for a human patient suffering from cancer, comprising: measuring by mass spectrometry the amount of an IRS1 fragment peptide in a protein digest prepared from a sample of formalin fixed tumor tissue from the patient and, optionally, calculating the level of IRS1 protein in said sample; and selecting a treatment based on the presence, absence, or amount of said IRS1 fragment peptide or the level of IRS1 protein in said sample, wherein the IRS1 fragment peptide is SEQ ID NO:70 or SEQ ID NO:76.La présente invention concerne des peptides spécifiques, et des caractéristiques d'ionisation dérivées des peptides, de la protéine substrat du récepteur à l'insuline 1 (IRS1) qui sont particulièrement avantageuses pour quantifier la protéine IRS1 directement dans des échantillons biologiques qui ont été fixés au formol par le procédé de spectrométrie de masse de surveillance de réaction sélectionnée (SRM), ou ce qui peut également être dénommé spectrométrie de masse de surveillance de réactions multiples (MRM). Ces échantillons biologiques sont chimiquement conservés et fixés, lesdits échantillons biologiques étant choisis parmi des tissus et des cellules traités avec des agents/fixateurs contenant du formaldéhyde comprenant des tissus/cellules fixés au formol, des tissus/cellules inclus en paraffine et fixés au formol (FFPE), des blocs de tissu FFPE et des cellules de ces blocs, et des cellules de cultures tissulaires qui ont été fixées au formol et/ou incluses en paraffine. Un échantillon de protéines est préparé à partir dudit échantillon biologique en utilisant le protocole et les réactifs Liquid Tissue™, et la protéine IRS 1 est quantifiée dans l'échantillon Liquid Tissue™ par le procédé de spectrométrie de masse SRM/MRM par quantification dans l'échantillon protéique d'au moins un des peptides décrits. Ces peptides peuvent être quantifiés s'ils se trouvent sous une forme modifiée ou non modifiée. Un e
来源网站:
中国工程科技知识中心
来源网址:
http://www.ckcest.cn/home/

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