本发公开了一种含有纤维素酶的乳仔猪专用复合酶,属于饲料酶制剂领域。所述含有纤维素酶的乳仔猪专用复合酶,其特征在于,所述乳仔猪专用复合酶由以下重量份数的组分组成:中草药粉1-3份,木聚糖酶15-20份,纤维素酶5-10份,β-葡聚糖酶及其培养物10-20份,甘露聚糖酶3-5,蛋白酶2-10,中温α-淀粉酶2-5份。其中纤维素酶的生产菌种为里氏木霉(Trichoderma reesei)601-17,保藏编号为CCTCC M 2013540,制备方法如下:斜面菌株培养获得液体种子;发酵阶段采用低温、逐级接种相结合的方法;发酵液经离心,收集、浓缩、过滤、干燥获得纤维素酶。本产品中添加的纤维素酶、β-葡聚糖酶及其培养物含有益生菌和酶制剂,可有效提高饲料消化吸收效率且提高动物肠道健康。