The present invention relates to a method for efficiently controlling algae by a physico-chemical parallel treatment, and a method for controlling algae by treating an algae according to the present invention with an oxidizing agent or an organic acid together with hot water, It was confirmed based on the Colby's method that synergism which is remarkably superior to that in the case of treatment with the oxidizing agent or organic acid can be effectively applied to alleviate the occurrence of large- , It is possible to rapidly kill the green algae even under mild conditions (low temperature and compound concentration as compared with single treatment).본 발명은 물리화학적 병행처리에 의한 해조류의 효율적 제어방법에 관한 것으로, 본 발명에 따른 조류에 산화제 또는 유기산을 온수와 함께 병용처리하여 조류를 방제하는 방법은, 산화제 또는 유기산, 온수를 단독으로 조류에 처리할 경우와 비교하여 현저히 우수한 동반상승효과(synergism)가 발생하는 것을 콜비방법(Colby's method)에 근거하여 확인하였으므로, 해조류의 대량 발생시 이를 효율적으로 경감시키는데 적용 가능할 뿐만 아니라, 산화제 또는 유기산을 온수와 함께 병용처리함에 따라 온화한 조건(단독처리 대비 낮은 온도 및 화합물 농도)에서도 녹조를 빠르게 사멸시킬 수 있는 효과가 있다.