PURPOSE: A method and a pharmaceutical composition for inducing cell apoptosis are provided to overexpress proteins containing SET domains and to lower cell viability. CONSTITUTION: A method for inducing cell apoptosis comprises a step of overexpressing proteins containing SET domains of amino acid sequence number 1. The proteins are setd3 of sequence number 2. A pharmaceutical composition for inducing cell apoptosis contains the proteins or a gene encoding the same as an active ingredient. The pharmaceutical composition is used for preventing and treating cancer, diabetes, artheriosclerosis, inflammatory bowel diseases, autoimmune diseases, transplantation rejection, post-traumatic immune response, infectious diseases, lymphatic tumor, multiple sclerosis, SLE, pachydermia, ischemia, stroke, uveitis or diabetic retinopathy.본 발명은 세포사멸을 유도하는 방법 및 이를 이용한 세포사멸 유도용 약학 조성물을 제공하고자 하며, 보다 구체적으로 SET 도메인을 함유한 단백질을 과발현시키면 이의 HMTase 활성에 의해 전사가 활성화되고 세포사멸과 관련된 유전자들이 조절되어 세포 생존력을 낮추므로, 본 발명에서는 SET 도메인을 함유한 단백질을 과발현시켜 세포사멸을 유도하는 방법을 제공하며, 또한 세포사멸을 유도함으로 암, 당뇨병, 관절염, 염증성 장 질환, 죽상동맥경화증, 자가면역 질환, 이식 거부, 외상후 면역 반응, 감염성 질환, 림프계 종양, 림프종, 다발성 경화증, 전신 홍반성 루프스, 경피증, 허혈, 뇌졸중, 포도막염 또는 당뇨 망막증을 예방 및 치료에 본 발명의 조성물이 제공될 수 있다.