The present invention relates to a system and a method for measuring physiological stability, more particularly to a system and a method for measuring physiological stability capable of providing a customized stress/tiredness measurement value based on an individual different measurement reference using a duty suitability determination algorithm for flight safety. The present invention is characterized by comprising the steps of measuring and storing a psychomotor vigilance test (PVT) as a first parameter; measuring and storing heart rate variability (HRV) as a second parameter; and sequentially determining normality, caution, warning and abnormality through the stored information.본 발명은 생리적안정도 측정 시스템 및 그 방법에 관한 것으로서, 보다 상세하게는 비행안전을 위한 임무적합도 판정 알고리즘을 이용하여 개인별 평가기준을 달리하는 맞춤식 스트레스/피로 측정치를 제공할 수 있는 생리적안정도 측정 시스템 및 그 방법에 대한 것이다.본 발명은 1차 변수로 감각운동 반응 검사(Psychomotor Vigilance Test, PVT)를 측정하여 저장하는 단계와, 2차 변수로 심박변동률 (Heart Rate Variability, HRV)를 측정하여 저장하는 단계와, 상기 저장된 정보를 통하여 순차적으로 정상, 주의, 경고, 및 불능으로 판정하는 것을 특징으로 한다.