Disclosed are methods of in situ genomic modification of cells (e.g., stem cells, tissue stem cells, muscle stem cells, Sca-1* mesenchymal progenitor cells in skeletal muscle, CD140a* dermal mesenchymal cells) using sequence-targeting nucleases delivered via a virus (e.g., an AAV).L'invention concerne des procédés de modification génomique in situ de cellules (par exemple, des cellules souches, des cellules souches tissulaires, des cellules souches musculaires, des cellules progénitrices mésenchymateuses Sca-1* des muscles squelettiques, des cellules mésenchymateuses dermiques CD140a*) à l'aide de nucléases de ciblage de séquence administrées par l'intermédiaire d'un virus (par exemple, un VAA).