The present invention relates to a method for preparing biodegradable microspheres having improved stability and storage stability. According to the preparation method of the present invention, the morphological change of microspheres is minimized and the residual solvent is remarkably low, so that biodegradable microspheres having improved stability and storage stability can be produced.La presente invención se relaciona a un método para producir microesferas biodegradables que tienen seguridad mejorada y estabilidad en el almacenamiento, y un método para producir las mismas. La presente invención proporciona un método para preparar las microesferas biodegradables mientras que minimiza los cambios morfológicos de las microesferas y reduce significativamente los solventes residuales.