The present invention provides methods of producing FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (FkpA) polypeptides at very high levels of purity. Also provided are ultra-high purity FkpA and its use, for example, for use in immunoassays to demonstrate the removal of FkpA from biologics produced in bacteria. In addition, the invention provides methods of purifying polypeptides (eg, multispecific antibodies) produced in bacteria overexpressing one or more chaperones. The method includes affinity chromatography, mixed mode chromatography, and hydrophobic interaction chromatography. In some aspects, the invention provides compositions of polypeptides (eg, multispecific antibodies) substantially free of product specific impurities. 【Selection chart】 None本発明は、FKBP型ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼ(FkpA)ポリペプチドの非常に高いレベルの純度での産生方法を提供する。超高純度FkpA、及び、例えば、細菌中に産生された生物製剤からのFkpAの除去を示すための免疫アッセイで使用するための、その使用方法も提供される。加えて、本発明は、1つ以上のシャペロンを過剰発現する細菌中に産生されたポリペプチド(例えば、多重特異性抗体)の精製方法を提供する。本方法は、親和性クロマトグラフィー、混合モードクロマトグラフィー、及び疎水性相互作用クロマトグラフィーを含む。いくつかの態様では、本発明は、産物特異的不純物を実質的に含まないポリペプチド(例えば、多重特異性抗体)の組成物を提供する。【選択図】なし