本发明公开了一种普通小麦低分子量麦谷蛋白及其编码基因和应用,普通小麦低分子量麦谷蛋白的氨基酸序列如SEQ ID №:1所示,普通小麦低分子量麦谷蛋白的编码基因,如核苷酸序列如SEQ ID №:2所示;同时公开了一种鉴定普通小麦足否含有述SEQ ID №:2编码基因的方法。本发明首次在偃展4110的1A染色体上发现了等位变异类型GluD3‑13,可为小麦育种提供优异的外源基因;本发明等位变异类型GluD3‑13所对应的肽链P‑13,含有7个半胱氨酸残基的LMW‑GS,会降低面粉的蛋白,提升面粉品质的弱筋性,可作为杂交优质小麦材料的良好亲本。偃展4110足小麦优质育种的基因资源。