An apparatus, system and method for automatically detecting abnormal waveforms and removing these waveforms from physiological measurements is disclosed. For example, in some instances, the method includes collecting pressure data from an intravascular device disposed in a patient's blood vessel, the pressure data including a pressure waveform for each heartbeat cycle of the patient; Comparing the pressure waveform for each heartbeat cycle of the patient with a reference waveform to identify an abnormal pressure waveform; calculating a pressure ratio using pressure data from the intravascular device; Removing data from abnormal pressure waveforms from the calculation.異常波形を自動的に検出し、これら波形を生理学的測定値から削除する装置、システム及び方法が開示されている。例えば、幾つかの事例において、方法は、患者の血管内に配置された血管内装置から圧力データを収集するステップであって、該圧力データが該患者の各心拍サイクルに関する圧力波形を含むステップと;前記患者の各心拍サイクルに関する圧力波形を基準波形と比較して、異常な圧力波形を識別するステップと;圧力比を前記血管内装置からの圧力データを用いて計算するステップであって、前記異常な圧力波形からのデータが当該計算から除外されるステップと;を含む。