本发明公开了一种烟草鲨烯合酶蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。烟草鲨烯合酶基因NtSQS是烟草甾醇合成途径的关键调控基因。在幼嫩组织中特异高表达,将构建好的病毒介导的基因沉默载体TRV‑NtSQS接种本氏烟草,并得到高沉默效率的植株,检测本氏烟草中植物甾醇的含量,发现基因沉默植株中甾醇含量显著下降,下降了41.26%,表明沉默该基因可以显著的降低植物的甾醇含量。烟草鲨烯合酶基因NtSQS是烟草甾醇合成途径的关键调控基因,可用于调节烟草的甾醇含量,有助于低甾醇优质烟草的基因工程育种。